Setiap musim NBC Superstore mempunyai kesudahan akhir yang menggegarkan siri ini menjadi terasnya. Musim 1 berakhir dengan Glenn dipecat dan seluruh kakitangan berjalan keluar, sementara Musim 4 berakhir dengan Mateo dibawa pergi oleh ICE. Walau bagaimanapun, Musim 2 mempunyai final yang sangat dahsyat yang menyaksikan kedai itu benar-benar dirobohkan oleh angin puting beliung, yang mana siri ini menghabiskan banyak masa untuk diperlihatkan sebelum ia melanda.
Cloud 9 adalah rangkaian kedai diskaun besar-besaran yang mendapat pekerjanya melakukan sebanyak mungkin kerja dengan jumlah wang dan faedah yang minimum. Pada masa yang sama, mustahil Cloud 9 mengabaikan realiti dunia, yang tidak dapat dikendalikannya. Apabila syarikat mempunyai kedai di kawasan seperti St. Louis, Missouri, itu bermaksud membuat persiapan untuk menghadapi angin puting beliung yang mungkin mengembara di wilayah tersebut.
Itulah yang berlaku pada akhir Musim 2. Pada Episode 22, ribut besar melanda St. Louis yang terus menjadi semakin teruk. Tidak kira betapa buruknya cuaca, itu tidak menghentikan Brett yang legendaris daripada berusaha mengumpulkan keranjang belanja longgar di tempat letak kereta, tetapi angin puting beliung melanda kedai itu, menghancurkan bangunan itu sepenuhnya dan menyebabkan Brett dianggap mati.
Walaupun ini menggegarkan segalanya, itu adalah kemalangan yang hampir dijangkakan, kerana tornado disebut berulang kali sepanjang Musim 2. Pada lebih dari satu kesempatan, Glenn cuba menjalani latihan tornado kecemasan atau sekurang-kurangnya mengadakan semacam rancangan, tetapi dalam Episode 9, semua orang memotongnya ketika dia cuba membincangkannya. Perkara yang sama berlaku dalam Episode 18 ketika dia cuba membuat latihan puting beliung dan semuanya diabaikan.
Sementara itu, Episod 8 seharusnya menjadi salah satu panggilan bangun terbesar bagi semua orang di kedai. Amy dan Jonah pergi berbincang dengan Glenn mengenai masalah berkaitan pilihan raya ketika dia bertanya kepada mereka apakah mereka telah membaca memo terbaharu mengenai keselamatan. Sudah jelas bahawa mereka tidak terkejut ketika dia menunjukkan bahawa kedai itu baru-baru ini mendapatkan F untuk kesediaan angin puting beliung dan bangunan itu akan jatuh seperti rumah kad dalam satu, yang sebenarnya berlaku.
Walau bagaimanapun, momen terbayang-bayang terbesar turun pada Musim 2, Episod 3. Ketika cuba mencari sebiji guacamole yang berisi ibu jari Marcus yang hilang, Amy mengumpulkan kakitangan. Ketika Glenn dan Jeff masuk dalam perbualan, dia menutupnya dengan berpura-pura bercakap dengan mereka tentang apa yang harus dilakukan sekiranya berlaku puting beliung. Nasihatnya sangat buruk, tetapi ironinya ketika ini tidak hilang kerana kakitangan boleh menggunakan latihan keselamatan puting beliung.
Ketika puting beliung itu berlaku, Dina berusaha untuk mendakwa bahawa dia adalah orang yang menginginkan latihan ketika Glenn memanggil mereka selama ini. Apa pun, kedai dibuka semula pada Musim 3, Episode 1 setelah dibina semula dengan tempat perlindungan tornado yang baru. Walaupun senang, ia adalah keadaan yang terlalu sedikit, terlambat. Secara terbalik, ternyata Brett pulang dan tidak mati dalam puting beliung.
